Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcom1E9PZ54 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcom1E9PZ54 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms