Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30dE9PWL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30dE9PWL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30dE9PWL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms