Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8994E9PV04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8994E9PV04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms