Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syde2E9PUP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syde2E9PUP1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms