Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca3bE9PUL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca3bE9PUL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms