Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1110002E22RikE0CYV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1110002E22RikE0CYV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1110002E22RikE0CYV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms