Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10110D3Z5M2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10110D3Z5M2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms