Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms