Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms