Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf217D3YYI7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rnf217D3YYI7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf217D3YYI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rnf217D3YYI7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf217D3YYI7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms