Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrc5C3VPR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc5C3VPR6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc5C3VPR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms