Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdzd8B9EJ80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd8B9EJ80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms