Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syce3B5KM66 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce3B5KM66 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce3B5KM66 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms