Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clrn2B2RVW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms