Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skint2A7XUX6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms