Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2c2A7L9Z8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp2c2A7L9Z8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms