Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll11A4Q9F4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms