Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prr16A3KMN5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prr16A3KMN5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr16A3KMN5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms