Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf2A3KGV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms