Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc9bA3KGF9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc9bA3KGF9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms