Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Patl2A2ARM1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Patl2A2ARM1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms