Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Frmpd1A2AKB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Frmpd1A2AKB4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Frmpd1A2AKB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms