Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brwd3A2AHJ4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brwd3A2AHJ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brwd3A2AHJ4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brwd3A2AHJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms