Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ambra1A2AH22 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms