Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34dA2AGU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn34dA2AGU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn34dA2AGU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34dA2AGU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34dA2AGU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms