Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb561d1A2AE42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb561d1A2AE42 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms