Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm16A2A935 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Prdm16A2A935 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prdm16A2A935 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prdm16A2A935 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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