Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCQ8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCQ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A286YCQ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A286YCQ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms