Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RNP2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RNP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.4 ms