Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trbv26A0A0B4J1P5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv26A0A0B4J1P5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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