Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trbv31A0A075B5J5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv31A0A075B5J5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv31A0A075B5J5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms