Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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