Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lamc3Q9R0B6 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms