Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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