Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gpc1Q9QZF2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gpc1Q9QZF2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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