Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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