Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms