Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms