Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ybx3Q9JKB3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms