Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trim2Q9ESN6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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