Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Usp29Q9ES63 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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