Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clstn2Q9ER65 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms