Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Stx12Q9ER00 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms