Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms