Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms