Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alkbh4Q9D8F1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms