Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn22Q9D7U6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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