Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx29Q9D3S3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx29Q9D3S3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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