Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Fndc8Q9D2H8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Fndc8Q9D2H8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Fndc8Q9D2H8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Fndc8Q9D2H8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Fndc8Q9D2H8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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