Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim42Q9D2H5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Trim42Q9D2H5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trim42Q9D2H5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms